驻马店市中级人民法院院共设有内设机构24个，分别是办公室、政治部、监察处、研究室、立案一庭、立案二庭、刑一庭、刑二庭、少审庭、民一庭、民二庭、民三庭、民四庭、行政庭、赔偿办、审监庭、执行局、法警支队、技术处、行管处、老干部处、信息处、机关党委、审管办。所属二级单位2个（非独立，经费财政全供），分别为河南省法官学院驻马店分院和机关后勤服务中心。